现存的故城遗址，是高昌回鹃时期在唐代高昌城的基础上建设而成的，全城呈不规则正方形，总面积约220万平方米，城市布局大致与唐长安城相仿，在历经多年建设后形成今天的规模，它主要有三部分组成：
　　

　　外城：外城城墙轮廓基本完整，部分地段保存极好，周长约5．4公里，城墙基厚12米，高达11．5米。每面有2－3座城门，其中西面靠北的城门保存最为完好，有曲折的瓮城和大量的马面，均为夯土筑成，夯层厚8到12厘米，间杂少量的土坯，有极清晰的夹棍眼，外城的东南和西南部分，还可以看出有寺院的遗址。故城外城是掬氏高昌时期所建。出土文书中有“论块中城”、“东南坊”、“西南访”等记载，说明当时此城已有外、中之分，东、南、西、北之别，并有各城门的名称，如：青阳门、会德门等，同时在唐代西州时期还有子城。
　　

　　内城：内城居外城正中，即外城的中间，宫城的南面。城墙全为夯土筑成。西、南两面的城垣大部分还保存下来，间有破坏的地方，东面只能看到东北角的高地与东南角的一个土台基，北面正中和西北角还有一部分残垣基地，至于城门的遗址从地面上一点痕迹也找不到了。据测算，内城周长约3600米，和《隋书》中的记录基本一致。其建筑年代较外城早，平面呈南北长方形，内城主要是宫城和寺院建筑等。
　　

　　宫城居全城最北部，外城的北墙是宫城的北墙，内城的北墙是宫在的南墙。整个宫城平面呈长方形，周长约700米，西墙还有几处残基，连接起来，可以看出遗迹。东墙完全被破坏，什么也看不到了。宫城内留存下的许多高大的殿基，一般高3．5米至4米左右，夯层厚度约35-48厘米，可以看出是一座高达四层的宫殿建筑遗址。早期的宫城在今“可汗堡”内。鞠氏高昌时期随着外城的修建，宫城送迁至北部，南面而王，与隋唐时长安城的布局相似，回骼高昌时期宫城曾大动土木。

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